Les positivités persistantes des tests PCR restaient bien souvent un mystère quant à leur cause : réactivations du fait de lapersistance dans des sites profonds avec relargage tardif ou recontaminations? Aucune hypothèse n'était certaine car les coronavirus sont classiquement des virus lytiques qui ne s'intègrent pas au génome de l'hôte. A  ce titre, les résultats d'une étude américaine récente changent la donne car ils montrent que des parties du génome viral peuvent intégrer le génome des cellules hôtes grâce à un processus de transcription inverse. Il peut ensuite être exprimé sous forme de transcrits chimériques 
combinant à la fois des séquences virales et des séquences cellulaires. Cette découverte pourrait expliquer pourquoi certaines personnes restent positives longtemps après avoir guéri cliniquement. Ce mécanisme d'intégration qui n'était pas connu pour les béta coronavirus est largement répandu puisque environ8% de notre ADN est constitué de vestiges d'anciens virus.

Ref : L. Zhang et al, PNAS 2021/doi.org/10.1073/pnas.2105968118